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广泛靶向代谢组

广泛靶向代谢组是一种整合了非靶向和靶向代谢物检测技术优点的代谢组检测技术,利用高灵敏度AB Sciex QTRAP® 4500 LC-MS/MS液质联用仪和自建的植物初级与次级代谢物数据库(2200多种物质)、医学代谢物数据库(1500多种物质),可实现高通量、高灵敏、覆盖广、定性准的代谢物检测。广泛靶向代谢组可比较不同样本间代谢物的种类与丰度差异、筛选出在不同组间具有重要生物学意义的显著差异代谢物,并可定性定量检测低丰度痕量级化合物(pM级别)。

应用领域
胁迫应答机理研究
药用植物药用成分合成机理及药物代谢研究
蔬果花卉颜色改良育种
动植物生长发育机理研究
疾病biomarker筛选
疾病发生发展机制研究
药效与毒副作用研究

技术路线

分析内容
1. 标准信息分析

1.1 原始数据预处理(过滤、去冗余、峰识别、峰面积积分、积分校正)
1.2 代谢物鉴定
1.3 代谢物定量
1.4 PCA分析
1.5 (O)PLS-DA分析
1.6 差异代谢物筛选及聚类热图
1.7 差异代谢物KEGG通路富集分析

2. 定制化信息分析
2.1 代谢物调控网络分析
2.2 多组学关联分析(转录组、蛋白组、基因组等,需有相关数据)

样本要求
1. 植物组织:鲜样3-5g,干样1g以上,取样后马上液氮速冻,-80°保存。
2. 植物细胞:107个细胞,取样后离心,去除培养基,液氮速冻,-80°保存。
3. 动物组织:200mg鲜样,或20mg冻干粉,取样后马上液氮速冻,-80°保存。
4. 动物细胞:107个细胞,或200mg鲜重,或20mg冻干粉,液氮速冻,-80°保存。
5. 动物血清、血浆:200ul
6. 尿液:200ul,低温离心取上清液,加入叠氮化钠溶液20ul(0.0025mol/L),-80°保存。
7. 粪便:200mg鲜样,或20mg冻干粉,叠氮化钠处理,马上液氮速冻至少15min,-80°保存。
8. 体液、细胞培养液:500ul,液氮速冻,-80°保存。

项目周期
标准项目的运转周期是60个工作日。

参考文献
Chen W, Gong L, Guo Z, et al. A novel integrated method for large-scale detection, identification, and quantification of widely targeted metabolites: application in the study of rice metabolomics.[J]. Molecular Plant, 2013, 6(6):1769-1780.
Wang Y, Zhang X, Yang S, et al. Lignin Involvement in Programmed Changes in Peach-Fruit Texture Indicated by Metabolite and Transcriptome Analyses[J]. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2018.

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